邴原，字根矩，是北海朱虚人。从小家中就贫困，到十一岁的时候父亲更是不幸去世成为孤儿无依无靠。
从此邴原就一个人生活在家中，有一天他经过家旁的学堂时不禁感伤开始哭泣，学堂中老师看到他哭就问他为什么会哭，他就对老师说：“我是一个孤儿，更是一个穷人，我想能坐在里面的人没有一个会是孤儿和穷人，想了想就心中难过，就在不禁流泪。”老师想了想对他说：“你要是想读书的话也可以跟他们一样。”邴原回答老师说：“可是我没钱，交不起学费。”这个开明的老师笑着对他说：“你如果真有读书的志向，我愿意教你，不用你出学费。”就这样邴原开始进学读书，据说他在一个冬天就通篇背住了《孝经》与《论语》。
邴原之后就一直发奋苦读，聪明的他长大之后品行十分端正，于是他便想学习更多的知识，便想要出门求学，就到安丘拜访孙崧，想向他学习。孙崧却对他说：“你知道你家乡有个人叫郑君的吧。”邴原对他说知道，孙崧又对他说：“郑君学识渊博，很多人都向他学习，你却不远千里过来找我，是将郑君当为东家丘啊，你好像是不知道郑君这个人，你却跟我说知道是为什么？”邴原听了之后就对孙崧说：“先生说的很对，但你根本我不了解我的内心所向，你说郑君是东家丘，那就是说我是西家的愚夫了。人各有志，理想和追求的各不相同，才有从事不同职业的人，各个职业不知别的职业的难处。”孙崧听了就对他道歉，并愿意为邴原写推荐信，好方便邴原四处拜学。邴原知道他的好意，就带着信告别了。邴原认为读书学习是共同志向的人一起讨论，不是交朋友需要介绍，信是多余的，就把信放在家中，又再次出门。
人人都有癖好，邴原喜好喝酒，但他一想到喝酒乱志，不适合学习，为了苦学就毅然决然将酒给戒了。外出游学之时，自然交到不少朋友，有朋友当然会有酒，每次有人劝酒，他都摇摇头表示自己不会喝，滴酒不沾，最终学成学业，成为有名的学者。
割席断义的管宁是个品行节操高尚的人，邴原与他其名，都以品行著称，州府任命他们做官，他两都不愿意贪图荣华富贵去做官。之后黄巾起义爆发，邴原将家属安置好之后就藏进郁洲山中。担任北海国相的孔融推举邴原，邴原认为黄巾军势力庞大，就和同郡的刘政一起前往辽东郡。
可是辽东郡的太守公孙度畏惧讨厌刘政，想要杀了他，就把他的家人都抓住了，刘政独自一人逃脱。于是公孙度就张贴告示――只要敢窝藏刘政，就跟他一样的罪名。刘政此时被逼无奈，只能来找邴原，邴原想都没想就把他藏在家中，一个多月后，有个东莱人要从辽东回中原，于是邴原就将刘政给托付给他，叫他把刘政带去中原。然后去找公孙度说:“你前面想要除掉刘政，而现在刘政已经离开这个地方，也算是除去了吧。”公孙度点头，邴原又再对他说：“既然你此时的祸害已经除去，而刘政将来也会更加有成就，你为何不把刘政的家人给放了，而少结下一个仇人呢？”公孙度听了后就把刘政的家人给放了，邴原又出钱将他们送到刘政家中。
之后不久，邴原也回归中原，曹操听闻就召他为司空掾。建安十三年，曹操的爱子曹冲突然病逝，曹操伤心欲绝。正好邴原的女儿也在这个时候病死，曹操想要求将曹冲与邴原的女儿合葬。邴原推辞说：“合葬，是不符合礼仪的。邴原之所以追随明公，明公之所以接纳邴原，是因为都能遵守规则制度，决不改变的缘故。如果我这次听从了明公的命令，那就会变得平凡庸俗，明公难道认为这事值得做吗？”曹操于是打消了这个念头。
建安十五年，曹操调邴原为丞相征事。东曹掾崔琰曾在自己推让官职的奏记里说：“征事邴原、议郎张范，都秉赋德行纯正美好，志向行为忠正端方，清廉洁净足可以激励凡俗，坚贞自守足以求取事功，正是所谓龙凤的羽翼，国家的重宝。推举任用他们，将使不讲仁德的人远遁。”曹操出征时，经常留下邴原与张范，与曹丕一同居守。曹操对曹丕说：“有什么事情要多向这二人讨教。”于是，曹丕对邴原与张范执子孙礼。曹丕有次宴请宾客，酒酣之时，曹丕出了道难题：“君主和父亲各自都有疾病，救命的药丸只有一颗，是当救君上呢？还是当救父亲呢？”众说纷纭，自然有许多人愿意在太子面前表露忠心，偏偏邴原一言不发。曹丕问邴原这个药丸究竟该给谁？邴原回答道：“父亲！”曹丕也没有责难他。
邴原之后当了五官将长史，他闭门自守，没有公家事务绝不出门参与。后来曹操征讨孙权时，邴原随军出发，不幸于途中病逝，令人惋惜。